大型語言模型（LLMs）正在改變生物醫學科學，特別是在理解生物序列方面。基因組語言模型（gLMs）專注於DNA序列，能幫助預測基因組中重要的功能區域、設計新DNA序列，並促進轉移學習。儘管如此，開發有效的gLMs仍面臨挑戰，如數據質量、模型架構及評估指標等。解決這些問題對於gLMs在複雜生物系統中的應用至關重要。 PubMed DOI

你的專案專注於提升大型語言模型（LLMs）在基因組學的表現，特別是透過整合變異註解數據。你成功將1.9億條準確的變異註解整合進GPT-4o，讓使用者能查詢特定基因變異並獲得詳細解釋。雖然微調有助於提升表現，但檢索增強生成（RAG）在數據量和成本效益上更具優勢。這項研究不僅提高了變異解釋的可及性，也為未來基因組學的AI系統發展樹立了榜樣，展現了LLMs的潛力。公開數據集可依需求分享。 PubMed DOI

這項研究用大型語言模型，從GEM資料庫和文獻中自動萃取基因編輯細節，突破了原本資料庫的限制。這讓研究人員能更快找到重要基因、規劃實驗，提升基因編輯研究效率。相關工具和資料已在GitHub公開，方便大家使用。 PubMed DOI

大型語言模型（LLMs）能根據病人表現型有效排序相關基因，表現不輸甚至優於傳統生物資訊方法。LLMs 有潛力協助罕見遺傳疾病診斷，提升準確度並簡化流程，成為未來診斷新選擇。 PubMed DOI

作者提出FREEFORM架構，利用大型語言模型（LLMs）來做基因型-表現型預測的特徵選擇與工程。FREEFORM能善用LLMs的知識和推理力，在資料少時表現比傳統方法更好。這套工具已開源並在GitHub上公開。 PubMed

傳統基因集分析彈性有限，llm2geneset 利用大型語言模型，能根據基因和自然語言描述，動態產生專屬基因集，品質媲美甚至超越人工整理。這工具在解析高通量資料和找生物過程上，比傳統方法更有效。llm2geneset 已開源，網路上可免費取得。 PubMed DOI

這項研究用大型語言模型，從GEM資料庫和文獻中自動萃取、量化基因編輯資訊，突破現有資料庫限制，更清楚呈現基因在編輯中的角色，提升基因排序效率，幫助設計更好的基因編輯實驗。相關工具和資料已在GitHub公開。 PubMed DOI

大型語言模型正改變基因體醫療，能快速分析文獻和基因資料，提升診斷與治療建議的精準度。雖然還有挑戰待克服，但隨著技術進步和跨領域合作，未來 AI 將成為臨床基因體分析的主流工具，推動個人化醫療發展。 PubMed DOI

cGSA 是新一代 AI 基因集分析工具，運用大型語言模型，能針對特定疾病情境，精準排序相關路徑，減少雜訊和重複結果。實驗證明，cGSA 比傳統方法更有效，讓研究人員更容易找出有意義的生物學假說。 PubMed

罕見疾病診斷困難，因資料少且基因多樣。本研究評估大型語言模型（LLMs）在基因排序的表現，發現GPT-4表現最佳，但對知名基因有偏好且受輸入順序影響。採用分批處理可提升準確度並減少偏誤，有助加快罕見疾病基因鑑定與診斷。程式碼可在 GitHub 下載。 PubMed DOI