A review of large language models and autonomous agents in chemistry.
化學領域大型語言模型與自主代理的綜述。 Chem Sci 2025-01-20

大型語言模型（LLMs）在化學領域越來越重要，能協助分子設計、性質預測和合成優化。這篇綜述探討了LLMs的能力及其自動化對科學發現的影響，還提到基於LLM的自主代理，能執行文獻擷取和與自動化實驗室互動等任務。文章也涵蓋了這些代理在其他科學領域的應用，並檢視其最新發展與挑戰，如數據質量和模型可解釋性。未來建議發展更先進的多模態代理，並改善與實驗方法的合作。欲了解更多，可參 PubMed DOI

Harnessing Large Language Models to Collect and Analyze Metal-Organic Framework Property Data Set.
利用大型語言模型收集和分析金屬有機框架性質數據集。 J Am Chem Soc 2025-01-21

這項研究旨在從科學文獻中有效收集金屬有機框架（MOFs）的實驗數據，以解決稀缺數據的問題，並提升材料科學中機器學習的應用質量。研究團隊利用先進的大型語言模型，系統化提取並整理MOF數據，成功從超過40,000篇文章中彙編出詳細的合成條件和性質數據。整理後的數據庫用於分析合成條件、性質和結構之間的關係，並創建合成條件推薦系統，為優化合成策略提供實用工具，顯示實驗數據集在推進MOFs研究中的重要性。 PubMed DOI

Explainable Synthesizability Prediction of Inorganic Crystal Polymorphs using Large Language Models.
使用大型語言模型進行無機晶體多型體的可解釋合成性預測。 Angew Chem Int Ed Engl 2025-02-13

這項研究探討了機器學習在預測假想晶體結構可合成性上的應用，特別是微調過的大型語言模型（LLMs）。這些模型在訓練時使用人類可讀的結構描述，表現與傳統卷積圖神經網絡相當。透過正標籤-未標籤學習模型及結構的文本嵌入表示，預測準確性更佳。此外，LLM能生成清晰的解釋，幫助化學家理解影響合成的因素，並優化無法合成的結構，協助設計新材料。 PubMed DOI

Molecular analysis and design using generative artificial intelligence <i>via</i> multi-agent modeling.
利用多代理建模的生成性人工智慧進行分子分析與設計。 Mol Syst Des Eng 2025-03-03

這份報告探討了X-LoRA-Gemma大型語言模型（LLM）的應用，這是一個擁有70億參數的多代理生成式人工智慧框架，專注於分子設計。模型結合人類與AI的合作，透過雙重推理策略來優化分子互動，並使用主成分分析等技術識別目標性質。生成的候選分子顯示出預期的特性，報告預測這些AI技術將在分子工程中越來越普遍，並提供創新解決方案，同時也討論了相關的挑戰與機會。 PubMed DOI

LLM-Driven Synthesis Planning for Quantum Dot Materials Development.
基於 LLM 的量子點材料開發合成規劃。 J Chem Inf Model 2025-03-12

大型語言模型在材料科學的應用大幅推進了新材料的開發。我們提出了一個新框架，利用這些模型來優化合成特定性質的量子點材料的實驗程序。這個方法結合了合成協議生成模型和性質預測模型，並基於開源的大型語言模型進行微調，使用我們的合成數據進行訓練。過程中，首先生成針對特定性質的合成協議，然後用性質預測模型驗證其有效性。我們的實驗中產生了六種合成協議，其中三個成功改善了多項性質，顯示出我們框架在合成規劃中的有效性及多目標優化的潛力。 PubMed DOI

Large language models open new way of AI-assisted molecule design for chemists.
大型語言模型為化學家開啟了AI輔助分子設計的新途徑。 J Cheminform 2025-03-25

最近，人工智慧在分子設計上有了新進展，讓合成化學家能更輕鬆地創造特定功能的分子。雖然已有多款AI分子生成器，但使用這些工具仍需專業知識。為了解決這個問題，我們開發了ChatChemTS，一個基於大型語言模型的聊天機器人，透過簡單對話幫助設計新分子，並自動生成獎勵函數。我們的研究展示了它在設計色素和抗癌藥物方面的能力。ChatChemTS已開源，並可在GitHub上獲得，網址是 https://github.com/molecule-generator-collection/ChatChemTS。這項技術讓更多人能輕鬆使用AI進行分子設計。 PubMed DOI

Augmented and Programmatically Optimized LLM Prompts Reduce Chemical Hallucinations.
增強式與程式化優化的 LLM 提示可減少化學幻覺現象 J Chem Inf Model 2025-04-22

這項研究把增強式生成和機器學習優化的提示結合，讓大型語言模型預測分子TPSA的準確度大幅提升，預測誤差從62.34降到11.76。這方法不只減少模型產生幻覺，也不用重新訓練模型，就能擴展LLM在科學研究的應用。 PubMed DOI

Leveraging Prompt Engineering in Large Language Models for Accelerating Chemical Research.
運用提示工程於大型語言模型以加速化學研究 ACS Cent Sci 2025-04-28

大型語言模型像GPT正在改變化學研究，但因化學資料有限，常出現錯誤。透過精心設計提問（prompt engineering），能減少這些錯誤並提升推理能力。雖然這方法在化學領域還不普及，但已有像電池和自動化實驗室的應用案例。總結來說，結合這兩者能讓化學研究更精確可靠。 PubMed DOI

SynLlama: Generating Synthesizable Molecules and Their Analogs with Large Language Models.
SynLlama：利用大型語言模型生成可合成分子及其類似物 ArXiv 2025-05-05

作者介紹 SynLlama，一款專為小分子藥物合成路徑設計的 Llama3 微調模型。它能用常見原料和穩定反應模板，規劃出實用的合成步驟。SynLlama 資料需求低，對新原料也能應用，生成類似物和 hit expansion 表現都很優秀，是藥物化學家的實用工具。 PubMed

Designing a large language model for chemists.
為化學家設計大型語言模型 Patterns (N Y) 2025-06-09

**重點整理：** Zhao 等人開發了 ChemDFM，一款專為化學領域設計的大型語言模型，結合了通用 AI 能力和專業化學知識。它能夠解讀光譜數據、進行數值推理，還能連結化學工具和資料庫，成為科學研究與發現的重要助手。 PubMed DOI

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