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研究團隊開發了BERT-infect模型,專門用來預測哪些病毒可能感染人類,準確度比以往高,特別對過去較少研究的病毒也有好表現。即使病毒基因序列不完整,模型也能運作。不過,目前還難以精確辨識像SARS-CoV-2這類特定病毒的風險,顯示機器學習在預測新興人畜共通傳染病上,還有不少挑戰要解決。 PubMed DOI


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本研究探討果凍捲(JR)摺疊在病毒衣殼中的特徵,利用六種大型語言模型(LLMs)嵌入的邏輯回歸模型,成功達到超過95%的準確率,能區分JR序列與非JR序列。數據集涵蓋單一JR病毒、非JR病毒及結構相似的免疫球蛋白樣β-三明治蛋白。研究顯示,模型表現受數據質量影響大於LLM選擇。Bert-U100模型能有效識別JR特徵,並預測未分類病毒序列中的JR摺疊,顯示從序列數據預測JR摺疊的可行性。 PubMed DOI

公共衛生干預措施如疫苗接種和社交距離的成效,依賴於公眾的支持與遵守。社交媒體成為評估公眾參與的重要工具,但在緊急情況下,缺乏即時監測可能導致反應延遲。為此,我們開發了PH-LLM(公共衛生大型語言模型),專注於即時公共衛生監測,並建立了多語言數據集。PH-LLM在多項任務中表現優於其他模型,顯示其在公共衛生資訊監測上的潛力,能有效增強政策制定與危機應對。此研究部分由NIH贈款支持。 PubMed DOI

這篇研究用MAMMAL AI模型,僅靠序列資料就能準確預測抗體和流感HA抗原的結合及阻斷效果。模型對已知抗體和抗原表現優異(AUROC ≥ 0.91),對新抗原也不錯(AUROC 0.9),但遇到全新抗體時準確度會下降。這顯示AI有助於抗體篩選,但還需要更多元的抗體資料來提升預測新抗體的能力。 PubMed DOI

這項研究用NLP技術自動抓取SARS-CoV-2相關論文中的病患元資料。團隊用BERT模型訓練分類器,並比較生成式AI(Llama-3-70B)的表現。結果顯示,針對生醫或COVID-19文本預訓練的BERT模型效果最好,F1-score達0.776,明顯優於生成式AI(F1-score僅0.558)。這方法已應用於35萬多篇文章,有助於基因流行病學研究。 PubMed DOI

大型語言模型對澳洲傳染病管理很有幫助,能處理複雜資訊,但要安全有效,需有明確的實證、法規和指引。像檢索增強生成這類AI技術,還能進一步降低風險、提升效益。 PubMed DOI

PandemicLLM 是新一代疫情預測框架,把疾病傳播預測當成文字推理問題來解決。它結合即時多元資料(如防疫政策、基因監測、時序數據),透過 AI 與人類協作提示提升預測準確度。實測美國各州 COVID-19 資料,表現優於現有模型,能整合複雜非數值資訊,讓疫情預測更精準。 PubMed DOI

這篇綜述介紹深度學習(如LSTM、CNN、GANs、transformers和大型語言模型)在流感病毒預測和治療上的應用。因應病毒快速變異,深度學習能分析大量複雜資料,提升預測、治療和疫苗開發效率。文章強調AI優於傳統方法,並展望未來在個人化醫療和公衛管理上的發展。 PubMed DOI

這篇論文探討用AI,特別是大型語言模型,來自動化整理動物傳染病環境風險因子的文獻回顧。研究比較不同AI方法,目的是提升找出相關風險因子的效率和準確度,解決病原體快速變異、文獻需常更新的問題。 PubMed DOI

蛋白質-蛋白質交互作用(PPIs)對生物研究和新藥開發很關鍵。現在大型語言模型(LLMs)已能從蛋白質序列分析PPIs,處理大規模資料也沒問題。不過,還有像運算量大、資料不平衡和多種資料整合等挑戰。未來會持續優化,讓LLMs在生物領域發揮更大作用。 PubMed DOI

這項研究發現,像 GPT-4 這類大型語言模型,能準確從社群貼文判斷結膜炎疫情的類型、規模和原因,表現有時甚至比人類專家還好。雖然敏感度還有進步空間,但 LLM 未來有機會協助自動化公共衛生監測,幫助及早發現疫情並提醒相關單位。 PubMed DOI