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生物製造是一種創新技術,結合生物學、化學和工程,利用可再生資源和生物體透過發酵生產商品。相較於傳統石油化學過程,這種方法能顯著減少二氧化碳排放、降低能源消耗及成本。隨著系統生物學、合成生物學和生物資訊學的進步,加上人工智慧和高效能計算的應用,生物製造正朝向數據驅動的方向發展。本文回顧相關數據庫和大型語言模型的最新進展,探討未來挑戰及技術創新,期望能激發更多科學研究。 PubMed DOI


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BioinspiredLLM是一個新的開源大型語言模型,旨在協助生物和受生物啟發的材料科學領域。經過訓練後,它能夠幫助回憶資訊、支援研究任務,並產生創意想法。已顯示在材料設計上的潛力,可與其他人工智慧模型合作,提升效率。有助於整合知識領域,重新定義生物材料領域的設計流程。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs)是強大的人工智慧模型,應用在自然語言處理等任務上表現優異。透過深度學習技術,利用龐大數據訓練神經網絡的參數。LLMs在生物資訊領域展現潛力,可能超越語言建模能力。本文討論了知名的LLMs如BERT和GPT在生物資訊中的應用,包括基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、藥物發現和單細胞分析,並強調了LLMs在應對生物資訊挑戰上的潛力。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs)在醫學和臨床資訊學中扮演重要角色,能幫助突破和個人化治療。透過分析複雜的生物數據,揭示基因組學、蛋白質結構和健康記錄中的隱藏模式,對基因組分析、藥物開發和精準醫學有所助益。然而,必須面對數據偏見、隱私和道德等挑戰,才能負責任地應用。克服這些障礙將帶來分子生物學和製藥研究的重大進展,造福個人和社區。 PubMed DOI

微生物細胞工廠(MCFs)利用合成生物學技術生產化合物,但傳統方法繁瑣。現在透過人工智慧(AI)快速處理生物數據,提高效率,改進微生物生產。AI改變了設計-構建-測試循環,帶來更好結果。本文討論AI在基因組注釋、蛋白工程、功能蛋白設計和微生物生產途徑預測的應用,也探討了挑戰和大型語言模型(LLMs)的潛力。 PubMed DOI

最近,人工智慧和自動化的進展正在徹底改變催化劑的發現與設計,從傳統的試錯方法轉向更高效的高通量數位方法。這一變化主要受到高通量信息提取、自動化實驗、實時反饋和可解釋機器學習的驅動,促成了自駕實驗室的誕生,加速了材料研究的進程。近兩年,大型語言模型的興起也為這個領域帶來了更大的靈活性,改變了催化劑設計的方式,標誌著學科的革命性轉變。 PubMed DOI

人工智慧(AI)正在改變科學研究,像是蛋白質摺疊和文獻摘要等領域,但在天然產品研究中的應用卻受到限制。這主要是因為數據多樣且不平衡,分散在不同資料庫中,影響了深度學習模型的效能。為了解決這個問題,作者提議建立一個知識圖譜,整合天然產品數據,幫助開發更能模擬科學家決策過程的AI模型,並讓更多人能夠獲取這些數據,提升AI在該領域的應用。 PubMed DOI

最近,自然語言處理(NLP)領域因大型語言模型(LLMs)的出現而有了重大進展。這些模型基於深度學習架構,如變壓器(transformers),擁有數十億的參數和龐大的訓練數據,能在各種任務中達到高準確度。LLMs不僅在傳統NLP應用上表現出色,還在生物信息學中解決了複雜數據集的挑戰,協助基因組學和藥物發現等領域的研究,為生命科學的新發現鋪路。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs)如GPT和LLaMA在自然語言處理上表現優異,但在製藥製造等特定領域仍在探索中。本研究利用製造偏差的歷史記錄,旨在提升生產力、效率、品質和合規性。透過建立數據集,研究評估生成型LLMs和文本嵌入模型在處理偏差任務的能力。結果顯示,較大的生成模型在提取任務中表現佳,推理能力強,但也有幻覺行為。嵌入模型則能有效捕捉偏差類別的語義。整體而言,AI工具在製藥製造流程中展現出顯著潛力,並提出未來研究的方向。 PubMed DOI

最近,人工智慧(AI)和深度學習(DL)在醫療保健領域的進展非常顯著,尤其是大型語言模型(LLMs)的應用。這些模型改善了研究人員與AI系統的溝通,特別是在藥物開發上。回顧中強調了LLM在製藥領域的創新,並探討了其技術和倫理挑戰。預期未來LLM將在創新藥物的開發中扮演更重要的角色,助力突破性製藥的進展。 PubMed DOI

這篇評論強調大型語言模型(LLMs)在合成生物學(SynBio)教育與研究中的重要性,特別是在生物製造領域。文章比較了美國和中國的LLMs在解決SynBio問題上的表現,並探討了它們如何從非結構化數據中提取資訊、建立知識圖譜,及促進檢索增強生成。預期LLMs將提升代謝建模和工程中的設計-建造-測試-學習(DBTL)循環,並推動自動化實驗室的發展。最後,呼籲建立LLMs的基準、發展生物安全措施,並促進相關領域專家的合作。 PubMed DOI