原始文章

功能性蛋白質組學在癌症研究中非常重要,能幫助識別新的生物標記和治療目標。我們建立了一個全面的資源,包含近8,000名癌症患者和約900個癌症細胞系的數據,並挑選了近500種高品質抗體,涵蓋主要癌症通路。為了提升可用性,我們推出了DrBioRight 2.0(https://drbioright.org),這是一個直觀的生物資訊平台,結合大型語言模型,讓研究人員能深入分析和視覺化蛋白質組學數據,加速轉化為生物醫學見解。 PubMed DOI


站上相關主題文章列表

一個新的醫療保健聊天機器人已經開發,使用了大型語言模型和癌症實踐指南,為患者提供正確的健康資訊。這個機器人整合了117萬個標記的元數據集,並在Python 3.9中實施AI引導。為了確保擴展性,採用了OpenAI和LangChain框架,ChatGPT3.5提供了用戶友善的對話。從2023年9月到2024年1月,用戶可以選擇癌症類型和語言進行互動,回應的表現評分為90.98 ± 4.02。這個AI引導機器人的目標是幫助癌症患者快速獲得正確的醫療資訊。 PubMed DOI

這項研究評估了大型語言模型(LLMs)驅動的聊天機器人,如ChatGPT 3.5、CoPilot和Gemini,在提供前列腺癌資訊的有效性,並與官方病人指南進行比較。研究使用25個專家驗證的問題,根據準確性、及時性、完整性和可理解性進行評估。結果顯示,ChatGPT 3.5的表現優於其他模型,證明其為可靠的資訊來源。研究強調在健康領域持續創新AI應用的重要性,並建議未來探討AI回應中的潛在偏見及其對病人結果的影響。 PubMed DOI

BioMedGPT是一個新型的多模態大型語言模型,專為生物醫學研究設計,克服了現有模型的限制。它透過廣泛的生物醫學文獻進行預訓練,增強知識基礎,並整合2D分子圖、蛋白質序列與自然語言。實驗結果顯示,BioMedGPT在理解生物醫學文件及回答研究問題上,表現與人類專家相當,並在分子和蛋白質問答任務中顯著提升ROUGE-L分數。相關資源已在GitHub上公開,供大家使用。 PubMed DOI

這項研究探討生成大型語言模型(LLMs),特別是GPT,在癌細胞系藥物敏感性預測(DSP)中的應用。研究調整了提示工程技術,提升GPT在藥物基因組學數據上的表現,並與現有基準比較。 主要發現包括: 1. 開發三種提示模板,提升GPT處理結構化數據的能力。 2. 微調方法顯著提高F1分數,表現最佳。 3. GPT在GDSC數據集上F1分數提高16%,展現強大泛化能力。 4. 提供藥物與通路關聯的見解,與先前發現一致。 總體而言,研究顯示GPT可作為精準腫瘤學的有效工具,改善癌症治療策略。研究代碼和數據集已公開於GitHub。 PubMed DOI

本研究探討大型語言模型(LLMs)在膀胱癌管理中的表現。研究設計了100個臨床問題,評估六種LLMs的回應準確性。結果顯示,Claude-3.5-Sonnet以89.33%準確率最佳,ChatGPT-4為85.67%。GPT-3.5-Turbo經過兩階段訓練後,準確率從74.33%提升至100%。研究顯示,針對性訓練能顯著改善模型表現,並指出策略性改進可克服專業醫學應用中的限制。 PubMed DOI

**重點摘要:** 這項研究介紹了一個名為 GeneRxGPT 的工具,它結合了大型語言模型(LLMs)和最新的生醫文獻,讓癌症研究人員可以更輕鬆地發現藥物與基因之間的關係、找出新的治療標的、藥物再利用,以及更深入了解複雜的分子交互作用——而且不需要具備進階的電腦運算技能。 PubMed DOI

Ontolomics-P 是一款操作簡單的網頁工具,專門分析蛋白質體學資料。它用 LDA 主題建模、GO 語意相似度和 GPT-4o 再註解,能把複雜的生物功能整理成清楚易懂的主題,還整合 10 種癌症的蛋白質資料,讓分析更全面、結果更好懂,幫助推動蛋白質體學研究。 PubMed DOI

AI大型語言模型正改變癌症研究,能協助資料擷取、分析、病患配對及多元資料整合,讓流程更有效率、決策更快速。不過,資料隱私、準確性、成本和法規等問題,還是需要特別注意。 PubMed DOI

這項研究比較了PubTator 3.0、BioBERT和大型語言模型在生醫文獻資訊擷取上的表現。PubTator 3.0和BioBERT在找基因、藥物等實體最準,而BioBERT在判斷實體間關聯性最強。整體來說,AI輔助的NLP技術有助於整合生醫知識,推動精準癌症治療發展。 PubMed

蛋白質-蛋白質交互作用(PPIs)對生物研究和新藥開發很關鍵。現在大型語言模型(LLMs)已能從蛋白質序列分析PPIs,處理大規模資料也沒問題。不過,還有像運算量大、資料不平衡和多種資料整合等挑戰。未來會持續優化,讓LLMs在生物領域發揮更大作用。 PubMed DOI