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在生物學的數據分析領域,專家短缺影響了對複雜生物過程的理解及新療法的開發。為了解決這個問題,我們推出了名為 mergen 的 R 套件,利用大型語言模型(LLMs)來生成和執行數據分析代碼。研究人員只需用簡單文字描述分析目標,系統便能透過提示和反饋改善代碼生成。我們的評估顯示,雖然 LLMs在某些任務上有效,但在複雜分析中仍有挑戰。自我修正機制顯著提升了可執行代碼的生成比例,對於複雜度等級 2 和 3 的任務分別提高了 22.5% 和 52.5%。這項研究增進了對 LLM 能力的理解,並提供了實用的整合見解。 PubMed DOI


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大型語言模型有潛力改變科學數據的分析與溝通,但在準確性上仍有挑戰。洛瑞特腦研究所與塔爾薩大學開發的LITURAt系統,透過整合外部數據檢索和分析工具,旨在提供可靠的輸出,讓專家與非專家都能輕鬆使用。研究顯示,LITURAt在查詢一致性和準確性上表現優異,能改善科學數據分析的可及性。儘管有些限制,LITURAt仍顯示出促進數據驅動見解民主化的潛力。 PubMed DOI

這項研究評估大型語言模型(LLMs)在生成臨床試驗計畫書的有效性。研究人員使用LLM生成不同疾病和試驗階段的計畫書,並根據臨床思維、透明度、醫學術語和內容相關性四個標準進行評估。結果顯示,LLM在內容相關性和術語方面表現良好,但在臨床思維和透明度上則較差。為提升表現,研究人員採用檢索增強生成(RAG)方法,顯著改善了內容質量,提升了臨床思維和透明度的分數。這表明RAG方法能有效提升LLM在臨床試驗文件撰寫的可用性,並可能改變藥物開發過程。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs),像是ChatGPT,已經徹底改變了學術界的科學寫作與研究,提供了全方位的支援。生成式人工智慧(GAI)工具在假設形成、方法設計、數據分析到手稿準備等各階段都有所改善。這篇評論專注於LLMs在血液學研究中的應用,特別提到提示工程和檢索增強生成(RAG)框架等技術。這些技術能幫助研究人員創造更準確的內容,並降低錯誤資訊的風險。儘管GAI工具提升了研究質量,但也強調了科學誠信、倫理考量及隱私保護的重要性。 PubMed DOI

最近,大型語言模型(LLMs)在生物醫學資訊擷取(IE)方面的應用逐漸增多,但仍面臨提示工程和演算法開發的挑戰,且缺乏專門的軟體解決方案。為此,我們開發了 **LLM-IE**,這是一個用於建立資訊擷取管道的 Python 套件,能協助進行命名實體識別、實體屬性擷取及關係擷取。我們在 i2b2 臨床數據集上測試,發現其在實體擷取上達到超過 70% 的 F1 分數,實體屬性擷取約 60%。**LLM-IE** 還提供互動式 LLM 代理、先進的提示演算法及可視化工具,未來將持續增強與提升效率。 PubMed DOI

這篇研究回顧了LLM在自動化科學文獻回顧的應用,分析了172篇論文。多數專案用ChatGPT或GPT系列,特別在文獻搜尋和資料擷取上表現比BERT好。不過,實際上很少有論文註明用LLM協助。雖然LLM處理數值資料還有些限制,但未來很可能會大幅改變文獻回顧的流程。 PubMed DOI

這項研究發現,大型語言模型(LLMs)能自動從文本中擷取蛋白質交互等分子資料,表現比人工處理更有效率。雖然在部分基因細節上還有困難,但整體來說,LLMs有助於加速生物知識的發現與應用。 PubMed DOI

大型語言模型正改變基因體醫療,能快速分析文獻和基因資料,提升診斷與治療建議的精準度。雖然還有挑戰待克服,但隨著技術進步和跨領域合作,未來 AI 將成為臨床基因體分析的主流工具,推動個人化醫療發展。 PubMed DOI

這項研究比較多款大型語言模型在自動化 pharmacometrics 任務的表現,發現 Claude 3.5 Sonnet 在產生模型圖、參數表和報告上最準確且易用。ChatGPT 4o 雖能模擬,但遇到複雜模型會卡關。整體來說,LLMs 有助於簡化工作流程,但還是需要專家把關結果。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs)能自動化調整 Excel 健康經濟模型和技術報告到新情境,準確率高、成本低。只要幾分鐘、幾美元就能完成,且調整結果幾乎完美。這方法有望加快健康科技評估流程,讓病患更快取得治療。 PubMed DOI

調查發現,許多生物統計學家已用大型語言模型(LLMs)提升程式撰寫和寫作效率,但因錯誤和可靠性問題,仍需謹慎驗證。多數人希望有系統訓練和實用指引。研究也提出八大原則,協助生物統計學家負責任且有效運用LLMs。 PubMed DOI