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與藥物相關的不良事件(AEs)是重要的公共衛生議題,而FDA的藥物標籤文件對於藥物安全性研究至關重要。手動提取不良事件數據既耗時又需專業知識,難以跟上更新。為了解決這個問題,開發了名為AskFDALabel的自動化流程,利用大型語言模型(LLM)和檢索增強生成(RAG)技術。該系統在三個基準實驗中表現優異,DILI的F1分數達0.978,DICT為0.931,顯示出顯著提高不良事件註釋的效率與準確性,對藥物安全研究具有重要潛力。 PubMed DOI


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LLMs如ChatGPT可幫助監管機構處理龐大文件,但需克服專有信息處理、定製功能及輸出透明度挑戰。askFDALabel框架專為FDA藥物標籤開發,包含語義搜索和問答/文本生成模組,支援全面查詢。此框架可使小型LLMs成本效益地執行監管應用,展示了LLMs如何支持監管機構運作。 PubMed DOI

新藥開發和不良藥物反應檢測傳統上耗時且成本高,但隨著大規模醫療數據庫和大型語言模型的興起,藥物篩選變得更有效。本研究提出一個自動化高通量藥物篩選流程,具備多項優勢,包括估算藥物與疾病的關聯、整合藥物重新利用與監測、準確解析暴露時間等。研究分析了661萬名患者的數據,發現16,901對藥物-疾病組合顯著降低風險,11,089對則顯著增加風險,顯示出潛在的藥物重新利用和安全問題。這項研究展示了自然語言處理在藥物流行病學中的潛力。 PubMed DOI

哨兵系統是美國FDA用來監控藥物安全的重要工具,透過臨床數據來指導藥物標籤和安全通訊。然而,觀察性數據的可靠性常受到挑戰。最近,大型語言模型(LLMs)的進展為解決這些問題提供了新機會,能從電子健康紀錄中識別不良事件並支持流行病學研究。不過,LLMs的準確性依賴於有效的提示工程,且其基礎設施在醫療系統中並不普遍,可能影響數據分析的公平性。此外,LLMs可能產生不準確的信息,導致假陽性,影響監管評估。因此,雖然LLMs有潛力改善上市後監測,但仍需努力確保公平性和準確性。 PubMed DOI

藥物引起的肝損傷(DILI)是藥物安全性的重要議題,也是急性肝衰竭的主要原因。傳統的文獻搜尋方法因藥物相互作用的複雜性而效率不高,且手動整理容易出錯。近期,利用大型語言模型(LLMs)如LLaMA-2,研究人員開發了專門用於DILI分析的模型,並在CAMDA 2022的數據集上達到97.19%的準確率,顯示出LLMs在文獻識別上的潛力,可能簡化監管審查流程。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs),如OpenAI的GPT系列,在醫學領域展現潛力,特別是在腫瘤學中。研究評估了LLM在分類化療引起的主觀毒性方面的能力,結果顯示LLM在一般毒性類別的準確率為85.7%,但在特定類別的準確率僅為64.6%。雖然LLM的表現與腫瘤科醫生相當,但特定類別的準確性仍需改進。未來研究應聚焦於真實病人的驗證及即時互動能力,並考量數據準確性和隱私等倫理問題。總體而言,LLMs有潛力提升病人護理質量與效率。 PubMed DOI

這項研究探討大型語言模型(LLMs)在識別接受免疫檢查點抑制劑(ICI)治療患者的免疫相關不良事件(irAEs)中的應用,並與傳統手動裁定及ICD代碼進行比較。研究分析了超過12年的住院紀錄,發現LLMs在檢測irAEs的敏感性顯著高於ICD代碼,且效率更佳,平均每份病歷僅需9.53秒。總體來說,LLMs被認為是檢測irAEs的有效工具,提供更高的敏感性和效率。 PubMed DOI

不良藥物事件(ADEs)對住院率影響顯著,且與高發病率和死亡率相關。傳統的藥物安全監測依賴於不良事件報告系統,但社交媒體如X(前身為Twitter)提供了有價值的患者見解。本研究探討使用大型語言模型(LLMs)進行ADE分類,結果顯示RoBERTa-large模型表現最佳,F1指標達0.8,微調後的ChatGPT則為0.75。特徵分析顯示某些術語在識別ADE中至關重要,顯示LLMs在藥物安全監測中的潛力。 PubMed DOI

藥物基因組學(PGx)旨在根據個人基因特徵來個性化醫療,以提升藥物療效與安全性。不過,PGx 研究面臨數據分散和提取繁瑣的挑戰。本研究評估大型語言模型(LLMs),特別是 Llama3.1-70B,能否自動化從 FDA 藥物標籤中提取 PGx 資訊。結果顯示,該模型在識別藥物-生物標記對的準確率達 91.4%,並且在提取 PGx 類別的穩定性超過 85%。這不僅簡化了數據提取,還有助於改善個性化醫療,並為少數族群揭示新資訊,顯示 LLMs 在 PGx 研究中的潛力。 PubMed DOI

基於變壓器的語言模型在自然語言處理上有顯著進展,但在臨床環境中識別藥物不良事件的有效性受到非標準語言的挑戰。研究中,九個預訓練的模型在5,088對藥物-AE數據上微調,並在新加坡的去識別化出院摘要及MIMIC-III數據庫進行驗證。結果顯示,BioM-ELECTRA-Large-BiLSTM模型的F1分數比傳統機器學習提高了16.1%。透過應用規則精煉預測,假陽性減少,精確度提升。整體而言,這些模型在識別因果相關藥物-AE對方面表現優於傳統方法,但仍需額外規則以克服限制。 PubMed DOI

不良藥物事件(ADEs)在臨床試驗中是一大安全挑戰,因此預測這些事件對於開發更安全的藥物至關重要。我們推出了CT-ADE數據集,專注於單一藥物治療中的多標籤ADE預測,包含2,497種藥物和168,984對藥物-ADE配對,數據來自臨床試驗結果,並使用MedDRA標註。CT-ADE整合了治療和目標人群數據,便於比較分析。使用大型語言模型進行分析,最佳模型達到56%的F1分數,顯示上下文信息對預測ADE的重要性,使CT-ADE成為藥物安全風險評估的寶貴資源。 PubMed DOI