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藥物重定位有助於加速開發、降低成本及失敗率,但獲取可靠的負面數據仍是挑戰。為了解決這個問題,我們採用了正負標籤學習方法,並利用大型語言模型(GPT-4)分析前列腺癌臨床試驗,成功識別真負樣本,預測準確性顯著提升。透過我們的標記策略,建立了包含80種藥物的數據集,並評估了11,043種藥物的重定位潛力,找出980個前列腺癌治療候選者。這一方法可擴展至其他疾病,為新療法的發現提供更準確的數據支持。 PubMed DOI


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這項研究探討生成大型語言模型(LLMs),特別是GPT,在癌細胞系藥物敏感性預測(DSP)中的應用。研究調整了提示工程技術,提升GPT在藥物基因組學數據上的表現,並與現有基準比較。 主要發現包括: 1. 開發三種提示模板,提升GPT處理結構化數據的能力。 2. 微調方法顯著提高F1分數,表現最佳。 3. GPT在GDSC數據集上F1分數提高16%,展現強大泛化能力。 4. 提供藥物與通路關聯的見解,與先前發現一致。 總體而言,研究顯示GPT可作為精準腫瘤學的有效工具,改善癌症治療策略。研究代碼和數據集已公開於GitHub。 PubMed DOI

藥物引起的骨毒性是指某些藥物對骨骼的有害影響,這在臨床和藥物開發中都很重要。目前的毒性評估模型缺乏專門的數據和演算法。我們的研究收集了骨毒性分子的數據,並使用DeepSeek和ChatGPT等大型語言模型來預測其特性,準確率分別達到0.87和0.88。研究顯示,機器學習能有效評估藥物對骨骼健康的影響,改善安全協議,減少副作用,提升治療效果,並強調大型語言模型在預測分子毒性方面的潛力。 PubMed DOI

這項研究探討大型語言模型(LLMs),如GPT-3.5、GPT-4.0和Claude-opus,在化學與疾病關係提取中的挑戰,特別是標註數據不足的情況。研究發現,這些模型在精確提取上達87%的F1分數,但全面提取僅73%。模型在提示工程上的改進有限,且對正向關係的識別較佳。提取錯誤多因模型誤解生物醫學文本的隱含意義。最後,研究提供了增強提取任務的工作流程,並強調優化訓練數據的重要性。 PubMed DOI

傳統藥物設計又慢又容易失敗,深度學習模型像DrugGPT雖然能產生新分子,但常常沒用。DrugGen是改良版,結合真實資料和優化技術,能產生100%有效分子,預測和多樣性都更好。測試證明它有效,還能幫助藥物再利用和新藥設計,大大提升藥物開發效率。 PubMed DOI

**重點摘要:** 這項研究介紹了一個名為 GeneRxGPT 的工具,它結合了大型語言模型(LLMs)和最新的生醫文獻,讓癌症研究人員可以更輕鬆地發現藥物與基因之間的關係、找出新的治療標的、藥物再利用,以及更深入了解複雜的分子交互作用——而且不需要具備進階的電腦運算技能。 PubMed DOI

這項研究發現,開源大型語言模型(LLM)在從腫瘤臨床試驗描述中萃取基因生物標記資訊,並將試驗資料結構化方面,表現比GPT-4等封閉模型更好。即使沒特別調整,開源模型就很厲害,經過微調後準確度還能再提升。這有助於病患媒合合適的臨床試驗。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs)正大幅改變阿茲海默症藥物開發流程,能快速分析大量生醫資料、找出新藥標靶並設計新化合物。雖然還有資料品質和模型解釋性的挑戰,LLMs 已有效加速研究進展,為治療帶來新希望,也推動 AI 與生醫領域的合作。 PubMed DOI

研究人員用GPT-4提出乳癌新藥物組合,選用多種原本非治療癌症的FDA核准藥物,兩兩搭配後進行細胞實驗。結果發現,有些AI建議的組合效果比現有治療還好,顯示大型語言模型在新藥開發和科學假說產生上很有潛力。 PubMed DOI

這項研究發現,GPT-3.5-turbo-0125、GPT-4-turbo 和 GPT-4o 在腫瘤科藥物品牌名和學名的配對上表現很好,但在較複雜的臨床任務(如藥物交互作用判斷、診斷副作用等)則表現不穩定,甚至有偏誤。特別是 GPT-3.5-turbo-0125 偏好用品牌名。總結來說,這些模型在簡單任務上可靠,但臨床應用還需更嚴謹的評估與改進。 PubMed DOI

DrugReX 是一套結合知識圖譜、機器學習和大型語言模型的新系統,能更有效率地找出藥物再利用的潛力。實際應用在阿茲海默症時,不只找出新藥物候選,還能提供有文獻佐證的解釋,專家也認為這比單靠 LLMs 更可靠,有助提升藥物再利用的透明度和可信度。 PubMed DOI