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ESCARGOT 是一種創新的方法,結合動態思維圖和生物醫學知識圖譜,提升像 GPT-4 這樣的大型語言模型的效能。它解決了檢索增強生成技術的常見問題,如上下文長度限制和向量相似性搜索的不準確性,從而提高輸出可靠性,減少幻覺,特別在高精確度的開放式問題上表現優異。此外,ESCARGOT 提供更大的透明度,使用者能檢視代碼和知識請求,避免傳統模型的黑箱問題。它可作為 pip 套件使用,並可在 GitHub 上找到,網址是:https://github.com/EpistasisLab/ESCARGOT。 PubMed DOI


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近年來,大型語言模型(LLMs)在生物醫學領域展現潛力,但常面臨錯誤輸出和幻覺等問題。為了解決這些挑戰,我們開發了基於知識圖譜的思維(KGT)框架,將LLMs與知識圖譜結合,透過整合可驗證資訊來增強回應,顯著減少推理錯誤。KGT框架適應性強,能在多種開源LLMs中表現良好,並能發現藥物新用途及預測抗藥性。總體而言,KGT框架提升了LLMs在生物醫學的準確性與實用性。 PubMed DOI

這項研究強調大型語言模型(LLMs)在醫療領域的潛力,特別是透過檢索增強生成(RAG)來提升數據透明度和準確性。研究團隊開發了GuideGPT,一個能理解上下文的聊天機器人,整合了449篇科學文獻的知識,提供有關藥物相關性顳骨壞死(MRONJ)的資訊。與通用的PureGPT相比,GuideGPT在內容、科學解釋和一致性上表現更佳,顯示RAG能有效提升LLM的回應質量,成為臨床實踐中的重要工具。 PubMed DOI

這段文字探討大型語言模型(LLMs)如ChatGPT在生物資訊學,特別是基因組學中的限制,提到資料檢索不佳、幻覺及序列操作錯誤等問題。為了解決這些挑戰,作者提出NagGPT作為LLMs與資料庫的橋樑,幫助精煉查詢並提高資訊準確性。此外,還介紹了Genomics Fetcher-Analyzer,這個自訂GPT能讓ChatGPT生成並執行Python程式碼,進行生物資訊學任務,並使用各種基因組資料庫的資料。整體目的是增強ChatGPT在生物資訊學的功能,提升事實準確性和遵循指示的能力。 PubMed DOI

這項研究評估大型語言模型(LLMs)在生成臨床試驗計畫書的有效性。研究人員使用LLM生成不同疾病和試驗階段的計畫書,並根據臨床思維、透明度、醫學術語和內容相關性四個標準進行評估。結果顯示,LLM在內容相關性和術語方面表現良好,但在臨床思維和透明度上則較差。為提升表現,研究人員採用檢索增強生成(RAG)方法,顯著改善了內容質量,提升了臨床思維和透明度的分數。這表明RAG方法能有效提升LLM在臨床試驗文件撰寫的可用性,並可能改變藥物開發過程。 PubMed DOI

這段文字探討了在對生物文本,特別是表型描述進行註釋時的挑戰,尤其是使用本體詞彙的情況。傳統文本挖掘工具在理解上下文方面表現不佳,而像OpenAI的GPT這類大型語言模型則更適合需要語義理解的任務。作者提出利用GPT對*Arabidopsis thaliana*和森林樹木的表型觀察進行本體詞彙註釋,目標是達到與人工註釋相當的效果。這些流程包括將表型解析為簡潔概念,並使用嵌入向量相似度和檢索增強生成(RAG)方法來識別合適的本體詞彙,最終實現高準確度的自動註釋。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs),像是ChatGPT,已經徹底改變了學術界的科學寫作與研究,提供了全方位的支援。生成式人工智慧(GAI)工具在假設形成、方法設計、數據分析到手稿準備等各階段都有所改善。這篇評論專注於LLMs在血液學研究中的應用,特別提到提示工程和檢索增強生成(RAG)框架等技術。這些技術能幫助研究人員創造更準確的內容,並降低錯誤資訊的風險。儘管GAI工具提升了研究質量,但也強調了科學誠信、倫理考量及隱私保護的重要性。 PubMed DOI

檢索增強生成(RAG)透過整合最新數據,提升大型語言模型(LLMs)的準確性與上下文意識。這方法將文本轉為數值嵌入,幫助檢索與使用者查詢相關的數據片段,讓模型的回答更具時效性。在腫瘤學中,RAG能改善治療建議、增強臨床試驗匹配,並加速藥物開發。不過,RAG的效果取決於數據質量,偏見或不完整的信息可能導致錯誤結果,因此需謹慎實施並加強人類監督。 PubMed DOI

這項研究開發了一套用於提升核醫療診斷治療的聊天機器人架構,透過情境增強(RAG)讓大型語言模型能查找相關研究資料。測試五款主流LLM後發現,RAG能明顯提升答案品質,尤其CLAUDE 3 OPUS和GPT-4O表現最好。研究也提醒,目前問題範圍有限,未來應擴大題目多樣性並比較人類與AI的評分。 PubMed DOI

大型語言模型能幫助放射科減輕工作量,但還有像是亂編內容和資訊來源不明的問題。結合RAG技術能提升可靠性,但面對大量或複雜資料時還需改進。本文回顧LLMs最新進展及放射科應用案例,並提出未來研究方向。 PubMed DOI

這項研究證實,結合疾病專屬知識圖譜、先進大型語言模型和Graph-of-Thoughts方法,能大幅提升阿茲海默症藥物再利用的效率。全新ESCARGOT框架表現優於傳統方法,不僅加速藥物開發,也有望推廣到其他疾病領域。 PubMed DOI