CellTypeAgent 是一款新工具,結合大型語言模型和資料庫驗證,能自動又精確地標註單細胞 RNA 定序資料的細胞類型。它比現有方法更準確、錯誤率更低,已在九個資料集、36 種組織、303 種細胞類型上測試,展現出快速又可靠的標註潛力。 PubMed
我們提出一種新方法,結合NCBI Gene的基因描述和大型語言模型,將單細胞RNA定序資料轉換成有意義的向量。做法是先找出每個細胞表現量最高的基因,擷取基因註解,再用語言模型轉成向量,並依表現量加權。這樣不只提升解釋性,也讓細胞分群和分析更精準。 PubMed