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人類蛋白質圖譜是腎臟研究的重要資源,提供超過一千萬張免疫組織化學影像,顯示蛋白質在組織中的表達情況。儘管有豐富的數據,但免疫組織化學的半定量特性可能造成測量不一致。我們的研究比較了腎臟的RNA測序數據與人類蛋白質圖譜的結果,發現超過500種蛋白質在免疫組織化學中未被檢測到。這些差異可能來自生物學和技術因素,了解這些關係有助於深入認識腎臟的基因與蛋白質表達。 PubMed DOI


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研究分析了18隻小鼠的腎臟疾病模型,比較了整體和單細胞基因表達水平,並與人類的糖尿病腎病(DKD)做了對比。雖然單細胞基因表達變化主要是模型特定的,但在不同疾病模型中,途徑層面的變化是相似的。發現細胞類型比例的變化是基因表達差異的主要驅動因素。雖然小鼠模型和患者的單細胞基因表達變化有限重疊,但觀察到了一致的途徑層面變化。這研究提供了全面的小鼠腎臟單細胞圖譜,並強調了細胞異質性在推動基因表達變化中的重要性。 PubMed DOI

腎髓在保持身體平衡中扮演關鍵角色,但成年人腎臟髓質的基因表達和特徵尚未充分研究。一項研究分析了成年人腎臟皮質和髓質的數據,有助於了解腎髓的功能和發育,進而理解腎臟疾病。這些資料可透過表觀基因組瀏覽器門戶進一步研究。 PubMed DOI

研究發現不同腎淀粉樣變性有獨特蛋白質組成,補體蛋白質是關鍵。識別AL和ALECT2亞型,AL病例有14-3-3蛋白參與。發現與AL斑塊相關的特定蛋白,可改善腎臟存活率。結果顯示淀粉樣型和蛋白組有變異,補體蛋白在損傷中扮演重要角色。 PubMed DOI

這項研究建立了一個詳細的人類腎臟內皮細胞參考圖譜,揭示了其異質性和物種間的保守性。研究人員整合了七個單細胞RNA測序數據,識別出五種主要細胞類型,內皮細胞數量達29,992個。進一步分析顯示七個亞群,各具獨特的分子特徵和生理功能。研究強調人類與小鼠腎臟內皮細胞的相似性,並發現內皮細胞在血壓遺傳性中扮演重要角色。這個圖譜有助於理解腎臟內皮細胞在疾病和衰老中的變化,並提供了公眾可訪問的數據工具,促進進一步研究。 PubMed DOI

這研究探討高蛋白對腎臟健康和心臟風險的影響,使用先進技術觀察小鼠模型。結果顯示高蛋白導致腎功能異常,影響基因表達和細胞功能,最終導致損傷。研究強調蛋白尿對腎臟的複雜影響,並提供潛在治療方向。 PubMed DOI

透過分析與腎臟組織病理相關的血漿蛋白水平,可以預測慢性腎臟疾病(CKD)的嚴重程度。一項針對434名參與者的研究發現了35種與不同腎臟病變相關的蛋白質,較高水平與更嚴重的組織病理分數和較低的腎功能相關。一些蛋白質顯示出腎臟特定的表現模式,暗示它們有潛力作為CKD進展的血液標記。 PubMed DOI

這項研究探討了間質細胞在腎臟發育中的重要性,特別是在人體胎兒腎組織中識別的特定細胞群。研究人員提取了條碼化的cDNA,並創建了空間轉錄組庫,使用Seurat進行聚類分析,並整合單細胞與空間數據。他們發現與WNT信號通路相關的差異表達基因,這對腎臟發育至關重要。此外,研究強調了細胞間的配體-受體相互作用,並發現17個與腎病相關的基因主要在特定細胞類型中表達,增進了對間質細胞角色的理解。 PubMed DOI

腎纖維化在慢性腎病中扮演重要角色,但目前有效的診斷和治療選擇仍有限。最近研究顯示,RNA結合蛋白(RBPs)在纖維化過程中關鍵。研究人員分析了175個腎纖維化樣本和99個正常樣本,利用生物資訊學和機器學習技術識別重要RBPs。診斷模型顯示高準確性(AUC = 0.899),並得到外部驗證。這些RBPs參與免疫相關通路,並可能成為潛在治療靶點。此研究增進了對腎纖維化機制的理解,並提供了新的生物標記和治療方向。 PubMed DOI

低腎元數量與慢性腎病(CKD)及高血壓風險增加有關。為了研究腎元不足的影響,我們創建了一種新型近交大鼠模型(HSRA大鼠),其中75%的後代僅有一個腎臟。研究顯示,這些大鼠的腎元數量減少約20%,並在18個月時出現顯著的蛋白尿,顯示CKD風險增加。透過甲基化測序、單核RNA測序及蛋白質組學分析,我們發現多個基因及366個差異表達的蛋白質,特別是Deptor和Amdhd2基因,可能在腎臟發育中扮演重要角色,未來可用於改善腎元健康及減緩腎病進展。 PubMed DOI

最近的研究指出,補體基因在腎臟的局部表達對正常生理及病理狀況相當重要,但對這些基因與腎臟環境變化的關係分析仍不足。我們分析了健康人類、C57BL/6小鼠及腎臟移植排斥小鼠的單細胞RNA測序數據,並將50個補體基因分為五組。結果顯示,正常小鼠腎臟中補體基因表達較低,主要由巨噬細胞和系膜細胞表達,而移植排斥小鼠的表達則顯著增加。這些發現增進了我們對腎臟補體系統調控及其在腎臟疾病中的角色的理解。 PubMed DOI