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這項研究旨在改善從基因測序中提取病原微生物的知識,特別是透過宏基因組下一代測序(mNGS)。傳統方法耗時且容易受主觀影響,因此研究人員開發了一種自動化的問答(QA)模型。 關鍵步驟包括創建名為MicrobeDB的新數據集,涵蓋618篇論文的3,161個樣本和224種病原微生物。透過微調模型和數據增強,最終在測試集上達到88.39%的精確匹配和93.18%的F1分數,顯示出高準確性。這項研究為臨床解釋mNGS結果提供了有價值的自動化方法。 PubMed DOI


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研究評估了ChatGPT在微生物學中回答不同難度問題的表現,結果顯示平均得分為4.04分,約80%的正確率。一級和二級問題回答能力沒有明顯差異。研究指出ChatGPT有潛力自動回答問題,但需要進一步培訓和發展以提升學術應用表現。 PubMed DOI

研究比較了ChatGPT與人類回答基因問題的表現,發現ChatGPT準確率為68.2%,人類為66.6%,兩者在記憶問題上表現較好。然而,ChatGPT有時會對同一問題給出不同答案。儘管ChatGPT表現令人印象深刻,但在高風險場景如臨床應用中有限制,解決這些將對實際應用至關重要。 PubMed DOI

研究指出,ChatGPT 4.0協助病理學家和實驗室主任回答問題時,準確性高、完整性佳,還能節省時間。專家評分結果顯示,大部分回答不需額外工作。這個工具被視為安全且省時,特別適合回答醫療提供者的問題。在各病理學領域中表現一致,ChatGPT 4.0可能成為病理學家重要的資源。 PubMed DOI

資訊提取(IE)在NLP中很重要,可以從文本中找出事實知識,支援各種應用。在基因醫學中,準確提取患者數據的表現型對基因疾病診斷很重要。LLM的進步提高了從臨床報告中提取表現型的準確性。本文評估了ChatGPT和現有解決方案在這方面的效能,強調了比較方法對提升基因診斷的重要性。 PubMed DOI

生物醫學資料庫增加快速,分析資料對生物學和醫學至關重要。現有工具常難以完整處理條目或像人類一樣修正錯誤。大型語言模型(LLMs)如ChatGPT提供了新的查詢資料庫方式,但在擴展規模時會有挑戰。ChIP-GPT是基於GPT模型Llama微調的,能高精確度從序列讀取存檔中提取元數據。它能處理打字錯誤和缺失標籤,適應各種資料庫和問題。 PubMed DOI

研究使用GPT-4等大型語言模型回答病人的實驗室檢驗問題,結果顯示GPT-4回答通常更準確、相關、有幫助且安全。但在醫學背景下解釋不足及偶爾不準確。提升回答方法包括提示工程、擴充、檢索增強生成和評估。 PubMed DOI

病患常覺得實驗室檢驗報告難懂,常上網求助。研究發現,使用GPT-4等大型語言模型回答問題更準確、有幫助、相關且安全。但仍需改進處理不準確和缺乏個人化的問題。改進策略包括即時調整、擴充、檢索和評估回應品質。 PubMed DOI

這項研究評估了兩個人工智慧模型,ChatGPT-4 和 Gemini,在回答病毒學多選題的表現,涵蓋英語和阿拉伯語。研究使用 CLEAR 工具分析了 40 道題目的回答正確性,結果顯示 ChatGPT-4 在兩種語言中均優於 Gemini,英語正確率分別為 80% 和 62.5%,阿拉伯語則為 65% 和 55%。兩者在較低認知領域表現較佳,結果顯示人工智慧在醫療教育中的潛力,並強調了提升多語言有效性的必要性。 PubMed DOI

這項研究評估了大型語言模型(LLM),特別是ChatGPT,在回答結直腸癌相關病理問題的有效性。研究人員比較了ChatGPT的回答與腸胃科醫生的回答,並創建了一個互動系統,讓用戶上傳病理報告圖片以獲得AI生成的答案。結果顯示,對於常見問題,腸胃科醫生對AI的評價與傳統答案相似,但在特定報告問題上,AI的表現獲得更高評價。總體而言,ChatGPT能提供可信的病理問題答案,增強醫生與患者的溝通。 PubMed DOI

這篇論文探討基因數據在疾病診斷與治療中的重要性,特別是癌症研究,並指出將這些數據整合進臨床護理的挑戰,如電子健康紀錄的結構、保險成本及基因結果的可解釋性。研究也提到人工智慧(AI)和大型語言模型(LLMs)在解決這些問題上的潛力。儘管AI在醫學研究中的成功有限,但基於大量數據訓練的LLMs在基因分析上顯示出希望。研究評估了GPT模型在基因表達數據的預測能力,並與傳統機器學習方法進行比較,以探討其在預測癌症亞型的潛力。 PubMed DOI