近年來，大型語言模型（LLMs）在生物醫學領域展現潛力，但常面臨錯誤輸出和幻覺等問題。為了解決這些挑戰，我們開發了基於知識圖譜的思維（KGT）框架，將LLMs與知識圖譜結合，透過整合可驗證資訊來增強回應，顯著減少推理錯誤。KGT框架適應性強，能在多種開源LLMs中表現良好，並能發現藥物新用途及預測抗藥性。總體而言，KGT框架提升了LLMs在生物醫學的準確性與實用性。 PubMed DOI

隨著科學文章數量快速增加，如何組織和提取資訊成為一大挑戰，顯示出自動化的必要性。本研究探討利用大型語言模型（如OpenAI的GPT-4.0）來提取科學文獻中的關鍵洞察。我們開發了名為ArticleLLM的系統，透過手動基準微調來提升模型表現，並採用多演員LLM策略，結合多個微調模型的優勢，增強提取效果。本研究顯示LLMs在關鍵洞察提取上的潛力，並強調協作微調的好處，有助於提升學術文獻調查與知識發現的效率。 PubMed DOI

阿茲海默症是一種漸進性的神經系統疾病，影響全球數百萬人，導致認知能力下降和記憶喪失。傳統診斷方法難以早期檢測。本研究提出一種新方法，結合自然語言處理和大型語言模型，利用GenBERT來識別阿茲海默症的生物標記。透過整合臨床數據，GenBERT在早期預測方面表現優異，準確率達98.30%，並顯示出高敏感性和特異性，為阿茲海默症的早期診斷提供了可靠工具，可能改變未來的檢測與治療策略。 PubMed DOI

這項研究利用GPT-4.0整合臨床數據，開發了一個全面的敗血症知識圖譜。敗血症是一種變異性大的病症，傳統知識圖譜建構困難。研究者從中國西部三家醫院建立了多中心敗血症數據庫，收集了10,544名患者的數據。透過GPT-4.0的技術，成功生成了包含1,894個節點和2,021個關係的知識圖譜，顯示其在實體識別和關係提取上的優越性。這項成果不僅增進了對敗血症的理解，也為臨床決策提供了支持，成為未來研究的寶貴資源。 PubMed DOI

研究團隊整合生醫文獻和資料庫，建立阿茲海默症知識圖譜（ADKG），用NLP技術捕捉AD相關基因、藥物等複雜關聯。經ADKG訓練的模型能預測新關聯，並結合UK Biobank資料後，提升AD預測準確度。ADKG有助於加速治療與診斷發現，推動阿茲海默症精準醫療發展。 PubMed DOI

這項研究發現，大型語言模型（LLMs）能自動從文本中擷取蛋白質交互等分子資料，表現比人工處理更有效率。雖然在部分基因細節上還有困難，但整體來說，LLMs有助於加速生物知識的發現與應用。 PubMed DOI

DrugReX 是一套結合知識圖譜、機器學習和大型語言模型的新系統，能更有效率地找出藥物再利用的潛力。實際應用在阿茲海默症時，不只找出新藥物候選，還能提供有文獻佐證的解釋，專家也認為這比單靠 LLMs 更可靠，有助提升藥物再利用的透明度和可信度。 PubMed DOI

蛋白質-蛋白質交互作用（PPIs）對生物研究和新藥開發很關鍵。現在大型語言模型（LLMs）已能從蛋白質序列分析PPIs，處理大規模資料也沒問題。不過，還有像運算量大、資料不平衡和多種資料整合等挑戰。未來會持續優化，讓LLMs在生物領域發揮更大作用。 PubMed DOI

這篇論文提出 LLM-DDI 模型，結合 GPT 產生的分子嵌入和圖神經網路，利用生醫知識圖譜的語意關係來預測藥物交互作用。實驗證明，LLM-DDI 在真實資料上表現比現有方法更好，對藥物開發和臨床應用很有幫助。 PubMed DOI

這項研究證實，結合疾病專屬知識圖譜、先進大型語言模型和Graph-of-Thoughts方法，能大幅提升阿茲海默症藥物再利用的效率。全新ESCARGOT框架表現優於傳統方法，不僅加速藥物開發，也有望推廣到其他疾病領域。 PubMed DOI