Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis.
在單細胞RNA序列分析中評估GPT-4用於細胞類型標註。 bioRxiv 2024-04-08

單細胞RNA分析中標註細胞類型耗時且需要專業知識，但使用GPT-4大型語言模型能自動且精確標註。它與手動標註一致，可減少標註的工作量。為了推廣GPT-4的應用，開發了開源軟體套件GPTCelltype。 PubMed DOI

GeneGPT: Augmenting Large Language Models with Domain Tools for Improved Access to Biomedical Information.
GeneGPT: 利用領域工具增強大型語言模型，以提高對生物醫學信息的訪問。 ArXiv 2024-02-29

GeneGPT是一種教導大型語言模型使用NCBI網站回答基因組問題的方法。研究顯示GeneGPT在基因組任務上表現優異，平均得分達0.83。應用程式示範對上下文學習有效，GeneGPT能處理多跳問題，未來可增強特定錯誤類型。 PubMed DOI

Reference-free and cost-effective automated cell type annotation with GPT-4 in single-cell RNA-seq analysis.
在單細胞RNA序列分析中，使用GPT-4進行無參考和具成本效益的自動細胞類型標註。 Res Sq 2024-04-08

在單細胞RNA序列分析中，細胞類型的標註是重要的，但也很耗時。GPT-4，一個強大的語言模型，可以利用標記基因信息自動準確地標註細胞類型。已經證明它在各種組織和細胞類型上表現良好，有潛力減少標註細胞類型所需的努力和專業知識。 PubMed DOI

Evaluation of large language models for discovery of gene set function.
評估大型語言模型在基因集功能發現中的應用。 ArXiv 2023-10-20

功能基因組學研究利用OpenAI的GPT-4模型快速生成基因功能假說，開發了標記基因集名稱的流程，支援文本分析和引文。GPT-4表現優異，提供比傳統方法更豐富的資訊，經人工審查後確認可信度。顯示大型語言模型在功能基因組學研究中有潛力。 PubMed DOI

Evaluation of large language models for discovery of gene set function.
評估大型語言模型在基因集功能發現中的應用。 Res Sq 2024-02-10

本研究使用OpenAI的GPT-4大型語言模型，評估其在功能基因組學中的應用價值。結果顯示，GPT-4能夠生成具有生物醫學知識的基因功能假設，並提供比傳統方法更豐富的資訊。這顯示大型語言模型在功能基因組學研究中具有潛力成為有用的工具。 PubMed DOI

GenePT: A Simple But Effective Foundation Model for Genes and Cells Built From ChatGPT.
GenePT：從ChatGPT建立的基因和細胞的簡單而有效的基礎模型。 bioRxiv 2024-03-25

單細胞生物學領域近期有新進展，Geneformer和scGPT等複雜模型能從基因表現數據學習功能。GenePT是一簡單替代方案，利用ChatGPT嵌入基因，無需大量數據或訓練即可生成基因和細胞嵌入。GenePT在各項任務上表現優異，顯示利用語言模型嵌入可有效建立生物模型。 PubMed DOI

An evaluation of GPT models for phenotype concept recognition.
GPT 模型在表型概念識別中的評估。 BMC Med Inform Decis Mak 2024-02-10

臨床深度表型分析和註釋對於診斷罕見疾病和推進領域知識至關重要。研究發現，GPT模型在這些任務中表現良好，尤其在特定本體子集上優於其他工具。然而，使用大型語言模型仍面臨非確定性和高成本等挑戰。 PubMed DOI

GeneGPT: augmenting large language models with domain tools for improved access to biomedical information.
GeneGPT: 利用領域工具增強大型語言模型，以提高對生物醫學信息的訪問。 Bioinformatics 2024-03-04

GeneGPT是一種新方法，教導大型語言模型利用NCBI網站回答基因組學問題。研究顯示GeneGPT在基準任務中表現優異，得分0.83超越其他模型。研究強調GeneGPT處理多跳問題的能力，並提供改進見解。程式碼和數據可在GitHub找到。 PubMed DOI

Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis.
在單細胞RNA序列分析中評估GPT-4用於細胞類型標註。 Nat Methods 2024-04-08

在這項研究中，我們展示了GPT-4可以在單細胞RNA序列分析中使用標記基因數據準確標記細胞類型。GPT-4的標記與各種組織和細胞類型的手動標記相符，簡化了細胞類型標記的過程。我們還開發了一個名為GPTCelltype的R軟體套件，用於使用GPT-4進行自動細胞類型標記。 PubMed DOI

Survey on large language model annotation of cellular senescence from figures in review articles.
大型語言模型對評論文章中細胞衰老圖表的標註調查。 Genomics Inform 2024-06-21

研究探討了大型語言模型如GPT-4 with vision和GPT-4 Turbo在解讀生物醫學圖表上的表現。模型在分類和標註圖像方面表現良好，但在節點關係上有挑戰。圖表比標題更準確，但有時缺少細節。研究顯示語言模型在理解生物機制上有潛力，並提出改善生物醫學信息中關係呈現的方法。 PubMed DOI

原始文章

站上相關主題文章列表