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最近機器學習的進展促成了先進預測模型的誕生,能解決計算生物學中的複雜問題,並引發了對可解釋機器學習(IML)的興趣。IML旨在深入了解生物數據與過程,但目前在計算生物學領域中,對有效應用IML的指導仍然不足。本文探討了各種IML方法及評估技術,並指出在生物學應用中面臨的挑戰,強調IML與計算生物學研究者之間合作的重要性,以提升對這些技術的理解與應用。 PubMed DOI


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Transformer模型如BERT和GPT-3在自然語言處理領域有顯著進展,也廣泛運用在生物資訊研究。本文討論了Transformer結構對生物資訊的影響,從序列分析到藥物發現。雖然面臨數據異質性和計算成本挑戰,但也提及未來研究的機會。呼籲自然語言處理研究者、生物資訊學家和生物學家攜手合作,探索Transformer模型在生物資訊領域的新應用。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs)是強大的人工智慧模型,應用在自然語言處理等任務上表現優異。透過深度學習技術,利用龐大數據訓練神經網絡的參數。LLMs在生物資訊領域展現潛力,可能超越語言建模能力。本文討論了知名的LLMs如BERT和GPT在生物資訊中的應用,包括基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、藥物發現和單細胞分析,並強調了LLMs在應對生物資訊挑戰上的潛力。 PubMed DOI

人工智慧(AI)正在快速改變生物醫學研究,加速解決問題並分析龐大數據。AI在藥物設計、毒理學和材料辨識上的應用,有潛力改革科學研究的設計、數據分析和溝通方式。像ChatGPT和Perplexity這樣的大型語言模型改變了科學家之間的互動和溝通方式。雖然AI帶來好處,但也有風險,例如保密性不足和潛在偏見。本評論討論了AI對生物醫學研究現況和未來影響,並強調了需要考慮的利弊。 PubMed DOI

語言模型在醫學領域的應用具有重要潛力,但人們對其運作和能力仍不清楚。因此,有必要深入研究,提高模型的可解釋性。本文總結了目前在生物醫學領域中語言模型的研究,並指出未來的探索方向,以解決相關挑戰。這將有助於研究人員和從業者更好地了解語言模型在醫學領域的應用。 PubMed DOI

像ChatGPT這樣的大型語言模型非常厲害,不僅能處理人類語言,還能應用在分析DNA和蛋白質等生物數據上。它們可以辨識生物數據中的複雜規律,成為預測細胞系統的強力工具。這篇文章討論了各種大型語言模型及其在生物學中的應用,特別強調了它們在植物領域的潛力,但在這個領域中的應用仍不太普遍。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs)透過互動式學習,可改善醫學生的生物信息學教育。提供程式碼範本、解釋編碼元素、幫助解決錯誤,提升教育成果。LLMs在醫學研究中的應用已有案例。但內容可靠性需驗證。結合LLMs與傳統教學,有助醫學生應對生物信息學挑戰。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs)在醫學和臨床資訊學中扮演重要角色,能幫助突破和個人化治療。透過分析複雜的生物數據,揭示基因組學、蛋白質結構和健康記錄中的隱藏模式,對基因組分析、藥物開發和精準醫學有所助益。然而,必須面對數據偏見、隱私和道德等挑戰,才能負責任地應用。克服這些障礙將帶來分子生物學和製藥研究的重大進展,造福個人和社區。 PubMed DOI

在分子生物學中,探索分子間的關聯性至關重要,而大型語言模型(LLMs)的出現大幅推進了這一領域。這些模型在自然語言處理和圖像生成上表現優異,能夠從龐大數據集中捕捉複雜關係,成為基礎模型。 目前的數據集涵蓋RNA、DNA、蛋白質序列及單細胞和空間轉錄組,為模型開發提供了豐富基礎。未來,基礎模型的發展將專注於提升可解釋性、整合多組學數據及增強預測能力,對於改進我們對生物系統的理解及治療策略具有巨大潛力。 PubMed DOI

大型語言模型(LLMs)正在改變科學界,尤其是生物醫學領域。生物學的重點在於理解生物序列,這與自然語言處理的目標相似。基因組語言模型(gLMs)專門針對DNA序列訓練,能幫助我們更好地理解基因組及DNA元素的互動,進而揭示複雜的生物功能。這篇評論強調了gLMs在適應性預測、序列設計和轉移學習等方面的潛力,但在創建有效的gLMs時仍面臨挑戰,特別是對於大型且複雜的基因組物種。還討論了gLMs開發和評估時需考慮的重要因素。 PubMed DOI

深度學習,特別是大型語言模型(LLMs),在植物生物學中展現出很大的潛力,能為植物細胞系統提供新見解。蛋白質語言模型(PLMs)提升了我們分析核酸和蛋白質序列的能力,揭示生物數據中的複雜模式和關係。這不僅有助於識別序列模式和結構-功能關係,還能促進農業基因改良。透過整合深度學習,我們在植物性狀的基礎研究上能取得顯著進展。因此,戰略性地應用這些方法對推進植物科學和可持續農業至關重要。 PubMed DOI