原始文章

GENEVIC是一個由人工智慧驅動的聊天框架,旨在簡化基因數據的分析與知識發現。它能自動檢索、分析和可視化基因資訊,協助生物學家。主要功能包括生成蛋白質互作網絡、豐富基因集,並從PubMed和Google Scholar搜尋文獻。試點階段專注於阿茲海默症、精神分裂症及認知相關基因變異,幫助研究人員優先考慮重要變異。這個平台使用簡單,無需專業訓練,並在安全的HIPAA合規環境中運行,且代碼開源,促進基因研究的合作與發展。 PubMed DOI


站上相關主題文章列表

GeneGPT是一種教導大型語言模型使用NCBI網站回答基因組問題的方法。研究顯示GeneGPT在基因組任務上表現優異,平均得分達0.83。應用程式示範對上下文學習有效,GeneGPT能處理多跳問題,未來可增強特定錯誤類型。 PubMed DOI

個人化醫療利用基因資訊量身訂做治療,提升品質。藥物基因體學優化藥物反應。未來治療考慮基因、生活方式等,提供個別照護。ChatGPT預測個人化醫療和藥物基因體學前景廣大,但需克服限制。 PubMed DOI

Monarch計畫整合全球開放數據,幫助瞭解基因、環境和表現型之間的關係。他們運用本體論、數據模型和知識圖支持研究轉譯。Monarch應用程式整合了不同物種的基因、表現型和疾病數據,提供API存取精心編輯的數據集和分析工具。他們改進了基礎設施、數據整合系統和用戶界面,並開發了使用OpenAI的ChatGPT進行表現型數據分析的插件。更多資訊請參考monarchinitiative.org和github.com/monarch-initiative/monarch-app。 PubMed DOI

研究發現ChatGPT在回答遺傳疾病問題上表現不錯,但對於人類遺傳模式理解仍有限制和不準確之處。這顯示人工智慧如ChatGPT在基因組學上有潛力,但必須受到監督以確保醫學資訊的正確傳遞。 PubMed DOI

資訊提取(IE)在NLP中很重要,可以從文本中找出事實知識,支援各種應用。在基因醫學中,準確提取患者數據的表現型對基因疾病診斷很重要。LLM的進步提高了從臨床報告中提取表現型的準確性。本文評估了ChatGPT和現有解決方案在這方面的效能,強調了比較方法對提升基因診斷的重要性。 PubMed DOI

GeneGPT是一種新方法,教導大型語言模型利用NCBI網站回答基因組學問題。研究顯示GeneGPT在基準任務中表現優異,得分0.83超越其他模型。研究強調GeneGPT處理多跳問題的能力,並提供改進見解。程式碼和數據可在GitHub找到。 PubMed DOI

研究使用OpenAI的GPT-4開發AI助手,解釋藥物基因測試結果,提升臨床遺傳學決策,改善患者護理。AI助手採用RAG技術,結合CPIC數據庫,針對用戶提供個人化回答。相較ChatGPT 3.5,表現更佳,尤其在專業查詢方面。需改進回答準確性、相關性和語言表達。整合GPT-4與RAG提升效能,利用CPIC數據。挑戰在提高準確性、解決道德問題,發展專業基因/藥物模型。研究凸顯生成式AI在醫療支援和患者獲取複雜基因組學資訊的潛力。謹慎應用大型語言模型如GPT-4,可顯著提升對基因組學數據的理解,增進醫療服務。 PubMed DOI

BioNexusSentinel是一個用於RNA-seq和生物調控網絡探索的軟體平台,整合了視覺工具和Reactome生物模型。它包括基因表達分析器和細胞組織RNA-seq探索器,提高研究生產力,並在網絡建模和生物狀態分析中有應用。該項目在GitHub上可找到。 PubMed DOI

研究生物相互作用對了解複雜生物系統、推動研究和藥物開發至關重要。雖然手動審查是最佳方法,但現在也有自動化工具如GIX框架可協助。GIX簡化了提取過程,提高了準確性,並提供了信心因子。通過評估,GIX優於現有方法,並展現出與手動審查相當的穩定性。此外,GIX還能提供新信息,對大腸桿菌基因回路的推斷有實際應用價值。 PubMed DOI

GeneAgent是一個特別厲害的語言代理程式,可以自己跟生物資料庫互動,讓基因組知識發現更精準又少錯誤。它比一般模型更優秀,幻覺也減少到最低,提供可信賴的分析報告。經過在1,106個基因組上的測試,證實GeneAgent在揭示基因功能方面非常有效,加速了知識的探索。 PubMed DOI